Острые кишечные инфекции (ОКИ)
ОКИ являются одной из ведущих причин госпитализации инфекционные стационары. Представление об их этиологии у врачей клинической и лабораторной практики часто складывается на основе ознакомления с традиционной отечественной литературой, в которой до настоящего времени, доминируют необъективные представления о ведущей роли нескольких, хорошоизученных патогенов. Подобные представления тесно связаны с использованием доступных для широкогопрактического применения в рутиннойклинико-лабораторной практике диагностических тестов, которые в настоящее время не позволяют эффективно решать вопросы этиологической диагностики острых кишечных инфекций
Данный факт подтверждается тем, что в РФ до 65-67% заболеваний этой группы, согласно официальной статистике, составляют ОКИ неуточненной этиологии. Особой оперативности требует этиологическая верификация вспышек ОКИ, от которой зависит объем, характер, и в конечном итоге эффективность проводимых противоэпидемических мероприятий.
Не менее сложной является задача обнаружения возбудителей в объектах окружающей среды, которую приходится решать как при проведении планового контроля объектов водопользования, так и при расследовании эпизодов вспышек заболеваний.
О возбудителях
В соответствии с представленными в современной литературе данными наиболее часто выявляемыми и повсеместно распространенными этиологическими агентами ОКИ являются следующие бактериальные и вирусные агенты:
1. Бактериальные агенты
микроорганизмы рода Shigella и энтероинвазивные E.coli (EIEC);микроорганизмы рода Salmonella; термофильная группа микроорганизмов рода Campylobacter; такие возбудители эшерихиoзов как энтеропатогенные E.coli (EPEC) и энтероаггрегативные E.coli (EAEC).
2. Вирусные агенты (все нижеперечисленные вирусные агенты, за исключением аденовирусов, являются РНК содержащими)
ротавирусы группы А; норовирусы 2 генотипа; аденовирусы группы F (40 и 41типы); астровирусы.
Менее широкую, либо не повсеместную распространенность, но не менее высокую значимость при возникновении эпидемических вспышек, имеют следующие возбудители: V.cholerae; возбудители тифо-паратифозных заболеваний; иерсиниоза и псевдотуберкулеза; Clostridium difficilae; энтеротоксигенные E. coli (ETEC),энтерогеморрагические E. Coli (EHEC); норовирусы 1 генотипа; ротавирусы группы С; саповирусы.
Применение диагностических тестов на основе полимеразной цепной реакции (ПЦР) позволяет достичь максимальной оперативности и информативности проводимых исследований.
Вирусные патогены
Для диагностики ОКИ, вызываемых возбудителями вирусной природы, в нашей стране широко распространены лишь диагностические тест-системы для выявления ротавирусов группы А. В отношении всего комплекса других возбудителей ОКИ вирусной природы выбор диагностических тестов крайне ограничен, либо отсутствует.
Норовирусы
В соответствии с данными зарубежной литературы норовирус является наиболее частым возбудителем вспышек ОКИ небактериальной этиологии. Эта особенность связана с низкой инфицирующей дозой и высокой резистентностью в окружающей среде. Данные возбудители имеют очень вариабельные антигенные характеристики, затрудняющие создание эффективно работающих ИФА тест-систем, и некультивируются на культурах тканей.По этим причинам ПЦР является золотым стандартом как в клинической диагностике вызываемых ими заболеваний, так и при обнаружении их в объектах окружающей среды. С 2009 года в РФ введена официальная регистрация случаев заболевания норовирусной инфекцией.
Ротавирусы
Ротавирусы группы А являются наиболее частой причиной спорадических заболеваний ОКИ у детей. В отечественной литературе под термином ротавирусная инфекция чаще всего понимается заболевание, вызванное ротавирусами группы А. Но не следует забывать, что до 2-3% ротавирусной инфекции бывает связано с ротавирусами группы С, которые не выявляются серологическими тестами, используемыми для диагностики ротавирусной инфекции. Наибольшее распространение в клинической лабораторной диагностике получили ИФА тест-системы
для выявления антигенов ротавирусов в фекалиях. К сожалению, специфичность некоторых тест-систем очень невысока, что приводит к значительному количеству невалидных результатов исследований. По этой причине ВОЗ рекомендует применение ограниченного количества тест-систем для диагностики ротавирусной инфекции(.Базовые протоколы оценки бремени ротавирусных гастроэнтеритов по данным госпитализации и изучения обращаемости детей за медицинской помощью по поводу гастроэнтеритов на уровне обслуживаемого населения.). ИФА тест-системы не обеспечивают необходимую для обнаружения ротавирусов в окружающей среде чувствительность.
Астровирусы
Несмотря на несколько меньшую в сравнении с рота- и норовирусами распространенность, астровирусы обуславливают значительный пласт кишечных инфекций, у трети пациентов протекающий с явлениями колита. Наибольшее распространение для диагностики астровирусной инфекции в мире получили тесты на основе ИФА и ПЦР. В нашей стране отсутствуют коммерчески доступные ИФА тест-системы для выявления антигенов астровирусов.
Материал для определения ротавируса, норовируса, астровируса (Rotavirus/Norovirus/ Astrovirus): фекалии
Взятие материала: используют пробы фекалий массой (объемом) примерно 13 г (13 мл). Исследование мазков неинформативно из-за низкого содержания в них возбудителей. Пробу в количестве 1 г (примерно) отдельным наконечником с фильтром или одноразовыми лопатками переносят в специальный стерильный флакон.
Условия хранения и перевозки материала:
Образцы нативных фекалий:
- при комнатной температуре в течение 6 часов;
- при температуре 28 °С в течение 3 суток.